Python 数据分析中常用的可视化工具

1 Matplotlib

用于创建出版质量图表的绘图工具库,目的是为 Python 构建一个 Matlab 式的绘图接口。

1.1 安装

  • Anaconada 自带。
  • pip 安装

    pip install matplotlib

1.2 引用

import matplotlib.pyplot as plt

1.3 常用方法

figure

Matplotlib 的图像均位于 figure 对象中

  • 创建 figure

fig = plt.figure()

subplot

fig.add_subplot(a,b,c)

  • a,b 表示讲 fig 分割成 axb 的区域
  • c 表示当前选中要操作的区域,
    注意 ·:从 1 开始编号
  • 返回的是 AxesSubplot 对象
  • plot 绘图的区域是最后一次指定 subplot 的位置(jupyter 里不能正确显
    示)
  • 同时返回新创建的 figure 和 subplot 对象数组
    • fig,subplot arr=plt.subplots(2,2)
    • 在 jupyter 里可以正常显示,推荐使用这种方式创建多个图表

plt.plot()

作图方法。

# 在指定 subplot 作图

import scipy as sp
from scipy import stats

x = np.linspace(-5, 15, 50)
#print x.shape

# 绘制高斯分布
plt.plot(x, sp.stats.norm.pdf(x=x, loc=5, scale=2))

# 叠加直方图
plt.hist(sp.stats.norm.rvs(loc=5, scale=2, size=200), bins=50, normed=True, color=\'red\', alpha=0.5)
plt.show()

绘制直方图
plt.hist(np.random.randn(100), bins=10, color=\'b\', alpha=0.3)

绘制散点图

x = np.arange(50)
y = x + 5 * np.random.rand(50)
plt.scatter(x, y)

柱状图

x = np.arange(5)
y1, y2 = np.random.randint(1, 25, size=(2, 5))
width = 0.25
ax = plt.subplot(1,1,1)
ax.bar(x, y1, width, color=\'r\')
ax.bar(x+width, y2, width, color=\'g\')
ax.set_xticks(x+width)
ax.set_xticklabels([\'a\', \'b\', \'c\', \'d\', \'e\'])
plt.show()

矩阵绘图

m = np.random.rand(10,10)
print(m)
plt.imshow(m, interpolation=\'nearest\', cmap=plt.cm.ocean)
plt.colorbar()
plt.show()

颜色 标记 线型

ax.plot(x,y,\'r--\') == ax.plotx,y,linestyle=--\',color=r\')

刻度、标签、图例

  • 设置刻度范围
    • plt.xlim(),plt.ylim()
    • ax.set_xlim(),ax.set_ylim()
  • 设置显示的刻度
    • plt.xticks(),plt.yticks()
    • ax.set_xticks(),ax.set yticks)
  • 设置刻度标签
    • ax.set_xticklabels(),ax.set yticklabels()
  • 设置坐标轴标签
    • `ax.set_xlabel(),ax.set ylabel0()
  • 设置标题
    • ax.set title()
  • 图例
    • ax.plot(label=legend\')
    • ax.legend),plt.legend()

      • loc=‘best\' 自动选择放置图例最佳位置

matplotlib 设置

plt.rc()

Customizing matplotlib

1.4 3D 绘图

matplotlib 支持 3D 绘图

下面代码给出了不同年份中,不同国家的平均寿命。

import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import pandas as pd
import numpy as np
import matplotlib; matplotlib.style.use(\'ggplot\')

%matplotlib inline

# 读取 csv 数据集
lexp = pd.read_csv(\'lexpectancy.csv\')
lexp.dropna(inplace=True)
lexp.reset_index(inplace=True)
plot_data = lexp[[\'Country\', \'1960\', \'1970\', \'1980\', \'1990\', \'2000\']][:3]
print(plot_data)

fig = plt.figure(figsize=(10, 8))
ax = fig.add_subplot(111, projection=\'3d\')

country_list = plot_data[\'Country\'].values.tolist()
year_list = [\'1960\', \'1970\', \'1980\', \'1990\', \'2000\']

for i, (color, z) in enumerate(zip([\'r\', \'g\', \'b\'], [0, 10, 20])):
    age_list = plot_data.iloc[i][1:].values.tolist()
    xs = np.arange(len(age_list))
    ys = age_list
    cs = [color] * len(age_list)
    ax.bar(xs, ys, zs=z, zdir=\'y\', color=cs, alpha=0.8)


ax.set_xticklabels(year_list)
ax.set_yticks([0, 10, 20])
ax.set_yticklabels(country_list)

ax.set_xlabel(\'Year\')
ax.set_ylabel(\'Country\')
ax.set_zlabel(\'Age\')

更多参考 mplot3d tutorial

2 Seaborn

什么是 Seaborn

  • Python 中的一个制图工具库,可以制作出吸引人的、信息量大的统计图
  • 在 Matplotlib 上构建,支持 numpy 和 pandas 的数据结构可视化,甚至是 scipy 和 statsmodels 的统计模型可视化

特点

2.2 安装

conda 安装:conda install seaborn
pip 安装:pip install seaborn

2.3 引用

import seaborn as sns

2.4 数据集分布可视化

  • 单变量分布 sns.distplot)
    • 直方图 sns.distplot(kde=False)
    • 核密度估计 sns.distplot(hist=False)或 sns.kdeplot)
    • 拟合参数分布 sns.distplot(kde=False,fit=)
  • 双变量分布
    • 散布图 sns.jointplot0
    • 二维直方图 Hexbin sns.jointplot(kind=‘hex)
    • 核密度估计 sns.jointplot(kind=‘kde\')
  • 数据集中变量间关系可视化 sns.pairplot()

2.5 类别数据可视化

  • 类别散布图
    • sns.stripplot() 数据点会重叠
    • sns.swarmplot() 数据点避免重叠
    • hue 指定子类别
  • 类别内数据分布
    • 盒子图 sns.boxplot(),hue 指定子类别
    • 小提琴图 sns.violinplot(),hue 指定子类别
  • 类别内统计图
    • 柱状图 sns.barplot()
    • 点图 sns.pointplot()

3 Bokeh

什么是 Bokeh

  • 专门针对 Web 浏览器的交互式、可视化 Python 绘图库
  • 可以做出像 D3.,js 简洁漂亮的交互可视化效果

特点

  • 独立的 HTML 文档或服务端程序
  • 可以处理大量、动态或数据流
  • 支持 Python(或 Scala,R,Julia.)
  • 不需要使用 Javascript

Bokeh 接口

  • Charts:高层接口,以简单的方式绘制复杂的统计图
  • Plotting:中层接口,用于组装图形元素
  • Models:底层接口,为开发者提供了最大的灵活性

3.1 安装

conda 安装:conda install bokeh
pip 安装:pip install bokeh

3.2 引用

  • 生成. html 文档
    from bokeh.io import output file
  • 在 jupyter 中使用
    from boken.io import output_notebook

3.3 bokeh.charts

引用和导入数据

# 引用
from bokeh.io import output_notebook, output_file, show
from bokeh.charts import Scatter, Bar, BoxPlot, Chord
from bokeh.layouts import row

import seaborn as sns

# 导入数据
exercise = sns.load_dataset(\'exercise\')
# 在使用 Jupyter notebook 时设置
output_notebook()

散点图

p = Scatter(data=exercise, x=\'id\', y=\'pulse\', title=\'exercise dataset\')
show(p)

柱状图

p = Bar(data=exercise, values=\'pulse\', label=\'diet\', stack=\'kind\', title=\'exercise dataset\')
show(p)

盒子图

box1 = BoxPlot(data=exercise, values=\'pulse\', label=\'diet\', color=\'diet\', title=\'exercise dataset\')
box2 = BoxPlot(data=exercise, values=\'pulse\', label=\'diet\', stack=\'kind\', color=\'kind\', title=\'exercise dataset\')
show(row(box1, box2)) # 显示两张图

弦图 Chord

  • 展示多个节点之间的联系
  • 连线的粗细代表权重
chord1 = Chord(data=exercise, source="id", target="kind")
# value 设置以什么为粗细
chord2 = Chord(data=exercise, source="id", target="kind", value="pulse")

show(row(chord1, chord2))

更多参考:Bokeh 官网

3.4 bokeh.plotting

from bokeh.plotting import figure
import numpy as np

p = figure(plot_width=400, plot_height=400)
# 方框
p.square(np.random.randint(1,10,5), np.random.randint(1,10,5), size=20, color="navy")

# 圆形
p.circle(np.random.randint(1,10,5), np.random.randint(1,10,5), size=10, color="green")
show(p)

更多图形元素参考:Bokeh 官网

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