章节概要

  1. Seaborn介绍:
  2. 安装Seaborn
  3. 加载库和数据文件
  4. Seaborn的绘图功能
  5. 用Matplotlib定制
  6. Pandas的作用
  7. Seaborn 主题
  8. 调色盘
  9. 图形重叠
  10. 融合数据
  11. 迷你画廊

安装Seaborn

首先确定你的电脑已安装以下应用

  • Python 2.7+ or Python 3
  • Pandas
  • Matplotlib
  • Seaborn
  • Jupyter Notebook(可选)

打开Jupyter Notebook, 过几秒钟会弹出网页窗口Home。
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点击右侧的New,新建一个Notebook,弹出一个新的网页窗口,点击上方可命名文件。
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Seaborn介绍:

Seaborn属于Matplotlib的一个高级接口,为我们进行数据的可视化分析提供了极大的方便。

加载库和数据文件

加载pandas、matplotlib、seaborn。

# coding: utf-8

#加载pandas
import pandas as pd

#加载matplotlib
from matplotlib import pyplot as plt

#在notebook中显示数据点
%matplotlib inline

#加载seaborn
import seaborn as sb

这里提供了一个数据文件,下载链接为
Pokemon.csv

用pandas读取数据文件,并显示前五行。

#用pandas读取Pokemon.csv
df = pd.read_csv("f:/Pokemon.csv", encoding = "unicode_escape")

#读取前五行,编译后的结果为一个列表。
df.head()
.dataframe tbody tr th:only-of-type { vertical-align: middle }
{ vertical-align: top }
.dataframe thead th { text-align: right }

# Name Type 1 Type 2 Total HP Attack Defense Sp. Atk Sp. Def Speed Stage Legendary
0 1 Bulbasaur Grass Poison 318 45 49 49 65 65 45 1 False
1 2 Ivysaur Grass Poison 405 60 62 63 80 80 60 2 False
2 3 Venusaur Grass Poison 525 80 82 83 100 100 80 3 False
3 4 Charmander Fire NaN 309 39 52 43 60 50 65 1 False
4 5 Charmeleon Fire NaN 405 58 64 58 80 65 80 2 False
#绘制散点图
sb.lmplot(x = \'Attack\', y = \'Defense\', data = df)
D:\Function\Anaconda3\lib\site-packages\scipy\stats\stats.py:1713: FutureWarning: Using a non-tuple sequence for multidimensional indexing is deprecated; use `arr[tuple(seq)]` instead of `arr[seq]`. In the future this will be interpreted as an array index, `arr[np.array(seq)]`, which will result either in an error or a different result.
  return np.add.reduce(sorted[indexer] * weights, axis=axis) / sumval





<seaborn.axisgrid.FacetGrid at 0x2ea94d27c50>

png

Seaborn的绘图功能

Seaborn最大的优点之一在于其种类繁多的绘图功能,下面我们利用lmplot()函数,用一行代码来绘制散点图。我们希望x轴显示Attack数据,y轴显示Defense数据,则可以编写代码。

事实上seaborn并没有专门用来绘制散点图的功能,实际上我们用它来拟合和绘制回归线。
幸运的是,我们可以通过设置函数的参数来得到我们想要的散点图。用fit_reg = False 移去回归线,用hug参数来用不同颜色显示Pokemon进化阶段的信息。

#移去回归线,用不同颜色来表示pokemon的进化阶段,即刻得到散点图:

sb.lmplot(x = \'Attack\', y = \'Defense\', data = df,
         fit_reg = False,
         hue = \'Stage\')
<seaborn.axisgrid.FacetGrid at 0x2ea950e4278>

png

从散点图可以看出,所有的数据点都分布在数轴的正半轴,然而散点图的数轴从负数开始的,我们可以对它进行改进。

用Matplotlib定制

虽然Seaborn是Matplotlib的一个高级接口,但是我们有时候也需要用到Matplotlib。其中包括设置数轴的范围。我们利用Matplotlib的ylim()和xlim()函数来设置数轴的范围。

#设置数轴范围


plt.gca().set(xlim = (0, None), ylim = (0, None),
             xlabel=\'Attack\', ylabel=\'Defense\')
[(0, 1.0), Text(0, 0.5, \'Defense\'), (0, 1.0), Text(0.5, 0, \'Attack\')]

png

Pandas的作用

尽管这是一个Seaborn教程,pandas依然在实际应用中起到了十分重要的作用。下面我们根据Pokemon的攻击数据来绘制箱形图

sb.boxplot(data = df)
#得到的箱形图: 
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea950c99b0>

png

很好,这是一个良好的开端,但是我们可以移除不需要的几列数据。

移除掉Total,因为我们有独立的统计数据。
移除掉Stage跟Legendary,因为它们不是攻击统计数据。
我们可以创建一个新的数据集stats_df,满足我们上述的要求。
#创建新数据集
stats_df = df.drop([\'Total\', \'Stage\', \'Legendary\'], axis = 1)

#Boxplot
sb.boxplot(data = stats_df)
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea962be358>

png

得到了一个改进了的箱形图。

Seaborn 主题

Seaborn的另一个好处就是其恰到好处、开箱即用的风格主题。其默认的主题为“darkgrid”
下一步,我们把主题改为“whitegrid”来创建一个小提琴图

小提琴图常常作为箱形图的替代
小提琴图通过小提琴的厚度展示了数据的分布,而不仅仅是总结数据。
根据Pokemon的主要类型,我们可以将Attack数据的分布可视化。 
#设置主题
sb.set_style(\'whitegrid\')

#violin plot
sb.violinplot(x = \'Type 1\', y = \'Attack\', data = df)
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea96343828>

png

可以得到小提琴图,x轴显示的是Pokemon的Type1,y轴显示的是不同Pokemon的攻击数值。

调色盘

Seaborn可以根据我们的需求,来设置颜色。我们可以创建一个python命令列表,用颜色的十六进制数值来设置。数值可以在Bulbapedia中寻找。

#创建颜色列表
pkmn_type_colors = [\'#78C850\',
                    \'#F08030\',
                    \'#6890F0\',
                    \'#A8B820\',
                    \'#A8A878\',
                    \'#A040A0\',
                    \'#F8D030\',
                    \'#E0C068\',
                    \'#EE99AC\',
                    \'#C03028\',
                    \'#F85888\',
                    \'#B8A038\',
                    \'#705898\',
                    \'#98D8D8\',
                    \'#7038F8\'
                   ]

#导入小提琴图中
sb.violinplot(x = \'Type 1\', y = \'Attack\', data = df,
             palette = pkmn_type_colors)

D:\Function\Anaconda3\lib\site-packages\scipy\stats\stats.py:1713: FutureWarning: Using a non-tuple sequence for multidimensional indexing is deprecated; use `arr[tuple(seq)]` instead of `arr[seq]`. In the future this will be interpreted as an array index, `arr[np.array(seq)]`, which will result either in an error or a different result.
  return np.add.reduce(sorted[indexer] * weights, axis=axis) / sumval





<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea94d24470>

png

为了能够让数据文件中的151个Pokemon都能够在图中简单展示,我们可以用群集图 swarm plot达到这一目的。

sb.swarmplot(x = \'Type 1\', y = \'Attack\', data = df,
            palette = pkmn_type_colors)
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea96d5bda0>

png

图形重叠

我们已经绘制出了小提琴图和群集图,Seaborn允许我们将这两张图整合在一张图上,步骤如下:

首先,我们用Matplotlib设置图形比例。
然后,我们绘制小提琴图,用inner = None将小提琴中间的木杆移去。
接着,我们绘制群集图,并将数据点的颜色变为黑色。
最后,我们可以用Matplotlib设置一个标题。
#设置图形比例
plt.figure(figsize = (10, 6))

#创建violinplot
sb.violinplot(x = \'Type 1\', y = \'Attack\', data = df,
              inner = None,
             palette = pkmn_type_colors)

#创建swarmplot
sb.swarmplot(x = \'Type 1\', y = \'Attack\', data = df,
             color = \'k\',
            palette = pkmn_type_colors)

#设置标题
plt.title(\'Attack by Type\')

#其中alpha为透明度。 编译后可以得到如下图形。 
Text(0.5, 1.0, \'Attack by Type\')

png

现在我们可以清晰的看到不同Pokemon的攻击值了。那么我们怎么看其他的数值呢?

融合数据

为了展现其他的数据,我们当然可以重复以上的步骤,绘制多张图。但是我们同样也可以在一张图上表示所有的数据,这时候pandas就派上用场了。
我们可以利用pandas的melt()函数来将一些数据进行融合,这样就可以在不同Pokemon之间直接进行比对,melt()需要导入3个参数,分别为:

需要融合的数据列表
需要保留的ID变量,其他变量将会被Pandas融合。
融合而成的新变量的名字。
#数据融合
melted_df = pd.melt(stats_df,
                   id_vars = [\'Name\', \'Type 1\', \'Type 2\'],
                   var_name = \'Stat\')

#前五行
melted_df.head()
.dataframe tbody tr th:only-of-type { vertical-align: middle }
{ vertical-align: top }
.dataframe thead th { text-align: right }

Name Type 1 Type 2 Stat value
0 Bulbasaur Grass Poison # 1
1 Ivysaur Grass Poison # 2
2 Venusaur Grass Poison # 3
3 Charmander Fire NaN # 4
4 Charmeleon Fire NaN # 5

我们为已经融合的数据列表melted_df绘制群集图。

#数据融合
melted_df = pd.melt(stats_df,
                   id_vars = [\'Name\', \'Type 1\', \'Type 2\'],
                   var_name = \'Stat\')

#前五行
melted_df.head()

#绘制群集图
sb.swarmplot(x = \'Stat\', y = \'value\', data = melted_df,
            hue = \'Type 1\')

#就可以得到如下的群集图。x轴为Stat中融合的六个变量,y轴为Stat的值,不同颜色代表不同的Pokemon Type 1。
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea9887da58>

png

这张图表有一些细节需要完善:

扩大图表。
使用split = True 来分隔色调。
使用我们自定义的颜色。
调整y轴的范围
将图例放在右侧。
#扩大图表
plt.figure(figsize = (10, 8))

#绘制群集图,使用split = True 来分割,使用自定义的颜色
sb.swarmplot(x = \'Stat\', y = \'value\', data = melted_df,
            hue = "Type 1",
            split = True,
            palette = pkmn_type_colors)

#调整Y轴的范围
plt.ylim(0,260)

#将图例放在右侧
plt.legend(bbox_to_anchor = (1,1), loc = 2)
D:\Function\Anaconda3\lib\site-packages\seaborn\categorical.py:2974: UserWarning: The `split` parameter has been renamed to `dodge`.
  warnings.warn(msg, UserWarning)





<matplotlib.legend.Legend at 0x2ea98a7f0b8>

png

即可得到一个已经细节完善后的图表。

迷你画廊

Heatmap

Heatmap可以帮助可视化矩阵状的数据。

#计算相关性
corr = stats_df.corr()

#Hteatmap
sb.heatmap(corr)
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea98dac4e0>

png

Histogram

Histogram能够绘制变量的数值分布。

#绘制直方图
sb.distplot(df.Attack)
<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea988d2da0>

png

Bar Plot

条形图可以帮助分类变量的可视化。

#绘制条形图abs
sb.countplot(x = \'Type 1\', data = df, palette = pkmn_type_colors)

#倾斜x轴的标签
plt.xticks(rotation = -45)
(array([ 0,  1,  2,  3,  4,  5,  6,  7,  8,  9, 10, 11, 12, 13, 14]),
 <a list of 15 Text xticklabel objects>)

png

Factor plots

Factor plots能够根据类别分离图表。

#分离图表
g = sb.factorplot(x = \'Type 1\',
                  y = \'Attack\',
                  data = df,
                  hue = \'Stage\',  #用不同的颜色表示Stage
                  col = \'Stage\',  #根据Stage来分离图表
                  kind = \'swarm\', #创建群集图
                 )

#倾斜x轴的标签
plt.xticks(rotation = -45)
D:\Function\Anaconda3\lib\site-packages\seaborn\categorical.py:3666: UserWarning: The `factorplot` function has been renamed to `catplot`. The original name will be removed in a future release. Please update your code. Note that the default `kind` in `factorplot` (`\'point\'`) has changed `\'strip\'` in `catplot`.
  warnings.warn(msg)





(array([ 0,  1,  2,  3,  4,  5,  6,  7,  8,  9, 10, 11, 12, 13, 14]),
 <a list of 15 Text xticklabel objects>)

png

可以得到根据Stage分离的三个图表,分别用不同颜色的点表示不同的Pokemon。

Density Plot

密度图显示的是两个变量之间的分布。
曲线越密集的地方说明两个变量的关系越近,越稀疏的地方说明关系越远。

#创建密度图
sb.kdeplot(df.Attack, df.Defense)
D:\Function\Anaconda3\lib\site-packages\scipy\stats\stats.py:1713: FutureWarning: Using a non-tuple sequence for multidimensional indexing is deprecated; use `arr[tuple(seq)]` instead of `arr[seq]`. In the future this will be interpreted as an array index, `arr[np.array(seq)]`, which will result either in an error or a different result.
  return np.add.reduce(sorted[indexer] * weights, axis=axis) / sumval





<matplotlib.axes._subplots.AxesSubplot at 0x2ea9a8d6f60>

png

Joint Distribution Plot

联合分布图将散点图和直方图的信息结合起来,提供双变量分布的详细信息。

#创建联合分布图
sb.jointplot(x = \'Attack\', y = \'Defense\', data = df)
<seaborn.axisgrid.JointGrid at 0x2ea9ab74da0>

png

这里只是介绍了Seaborn常用的绘图功能,还有更强大的功能Example gallery需要我们去学习,去探索。


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