这一章主要讲的是逻辑回归,逻辑其实只是比线性回归多了一个逻辑函数。线性回归问题是f(x)=WTX+b用最优化方法求解W使得error=f(x)-y最小。线性回归是用f(x)取拟合的,但是逻辑回归的y值是{0,1},所以这里需要用一函数将所有输入映射到{0,1}。本来单位阶跃函数是最理想的,但是求最优时涉及求导什么的,单位阶跃在定义域内不可导。故一般用Sigmoid函数,即:

  。Z=线性规划中的f(x)。这样一来问题还是用优化算法求最佳W。

  书中用的是梯度上升法与随机梯度上升法(训练样本大时用),梯度上升法与梯度下降基本差不多,一个求最大,一个求最小。书中不是损失函数,而是似然函数,故用梯度上升,下面复现书中的例子:

首先输入数据是.txt,是这样的:

 代码如下:

from numpy import *
import matplotlib.pyplot as plt

# 解析数据
def loadDataSet(file_name):
    \'\'\'
    Desc:
        加载并解析数据,应用范围是数据文件是.txt文件
    Args:
        file_name -- 文件名称,要解析的文件所在磁盘位置
    Returns:
        dataMat -- 原始数据的特征
        labelMat -- 原始数据的标签,也就是每条样本对应的类别
    \'\'\'
    # dataMat为原始数据, labelMat为原始数据的标签
    dataMat = []
    labelMat = []
    fr = open(file_name)
    for line in fr.readlines():
        lineArr = line.strip().split()
        if len(lineArr) == 1:
            continue    # 这里如果就一个空的元素,则跳过本次循环
        # 为了方便计算,我们将 X0 的值设为 1.0 ,也就是在每一行的开头添加一个 1.0 作为 X0
        dataMat.append([1.0, float(lineArr[0]), float(lineArr[1])])
        labelMat.append(int(lineArr[2]))
    return dataMat, labelMat


# sigmoid跳跃函数(有所改进)
def sigmoid(inX):
    # return 1.0 / (1 + exp(-inX))
    # Tanh是Sigmoid的变形,与 sigmoid 不同的是,tanh 是0均值的。因此,实际应用中,tanh 会比 sigmoid 更好。
    return 2 * 1.0/(1+exp(-2*inX)) - 1


# 随机梯度下降算法(随机化)
def stocGradAscent1(dataMatrix, classLabels, numIter=100):
    \'\'\'
    Desc:
        改进版的随机梯度下降,使用随机的一个样本来更新回归系数。步长a在这里是自适应的(可变的)
    Args:
        dataMatrix -- 输入数据的数据特征(除去最后一列数据)
        classLabels -- 输入数据的类别标签(最后一列数据)
        numIter=150 --  迭代次数
    Returns:
        weights -- 得到的最佳回归系数
    \'\'\'
    m, n = shape(dataMatrix)
    weights = ones(n)  # 创建与列数相同的矩阵的系数矩阵,所有的元素都是1,即回归系数的初始值
    # 随机梯度, 循环150,观察是否收敛
    for j in range(numIter):
        # [0, 1, 2 .. m-1]
        dataIndex = list(range(m))
        for i in range(m):
            # i和j的不断增大,导致alpha的值不断减少,但是不为0
            alpha = 4 / (
                1.0 + j + i
            ) + 0.0001  # alpha 会随着迭代不断减小,但永远不会减小到0,因为后边还有一个常数项0.0001
            # 随机产生一个 0~len()之间的一个值
            # random.uniform(x, y) 方法将随机生成下一个实数,它在[x,y]范围内,x是这个范围内的最小值,y是这个范围内的最大值。
            randIndex = int(random.uniform(0, len(dataIndex)))    #设置randIndex随机选取样本
            # sum(dataMatrix[i]*weights)为了求 f(x)的值, f(x)=a1*x1+b2*x2+..+nn*xn
            h = sigmoid(sum(dataMatrix[dataIndex[randIndex]] * weights))
            error = classLabels[dataIndex[randIndex]] - h
            # print weights, \'__h=%s\' % h, \'__\'*20, alpha, \'__\'*20, error, \'__\'*20, dataMatrix[randIndex]
            weights = weights + alpha * error * dataMatrix[dataIndex[randIndex]]
            del (dataIndex[randIndex])
    return weights


# 可视化展示
def plotBestFit(dataArr, labelMat, weights):
    \'\'\'
        Desc:
            将我们得到的数据可视化展示出来
        Args:
            dataArr:样本数据的特征
            labelMat:样本数据的类别标签,即目标变量
            weights:回归系数
        Returns:
            None
    \'\'\'

    n = shape(dataArr)[0]
    xcord1 = []
    ycord1 = []
    xcord2 = []
    ycord2 = []
    for i in range(n):
        if int(labelMat[i]) == 1:
            xcord1.append(dataArr[i, 1])
            ycord1.append(dataArr[i, 2])
        else:
            xcord2.append(dataArr[i, 1])
            ycord2.append(dataArr[i, 2])
    fig = plt.figure()
    ax = fig.add_subplot(111)
    ax.scatter(xcord1, ycord1, s=30, c=\'red\', marker=\'s\')
    ax.scatter(xcord2, ycord2, s=30, c=\'green\')
    x = arange(-3.0, 3.0, 0.1)
    """
    y的由来,卧槽,是不是没看懂?
    首先理论上是这个样子的。
    dataMat.append([1.0, float(lineArr[0]), float(lineArr[1])])
    w0*x0+w1*x1+w2*x2=f(x)
    x0最开始就设置为1叻, x2就是我们画图的y值,而f(x)被我们磨合误差给算到w0,w1,w2身上去了
    所以: w0+w1*x+w2*y=0 => y = (-w0-w1*x)/w2   
    """
    y = (-weights[0] - weights[1] * x) / weights[2]
    ax.plot(x, y)
    plt.xlabel(\'X\')
    plt.ylabel(\'Y\')
    plt.show()

#测试主函数
def simpleTest():
    # 1.收集并准备数据
    path = "E:\ML_data\logistic.txt"
    dataMat, labelMat = loadDataSet(path)

    # print dataMat, \'---\n\', labelMat
    # 2.训练模型,  f(x)=a1*x1+b2*x2+..+nn*xn中 (a1,b2, .., nn).T的矩阵值
    # 因为数组没有是复制n份, array的乘法就是乘法
    dataArr = array(dataMat)
    # print dataArr
    # weights = gradAscent(dataArr, labelMat)
    # weights = stocGradAscent0(dataArr, labelMat)
    weights = stocGradAscent1(dataArr, labelMat)
    # print \'*\'*30, weights

    # 数据可视化
    plotBestFit(dataArr, labelMat, weights)

if __name__ == \'__main__\':
    simpleTest()

书中的示例是从疝气病预测病马的死亡率:

只要在上面的基础加数据预处理代码即可,完整如下:

#!/usr/bin/env python
#-*-coding:utf-8 -*-

\'\'\'
基于随机梯度上升优化算法的逻辑回归。
里面包含两个测试,一个是简单的,一个是病马预测
\'\'\'

from numpy import *
import matplotlib.pyplot as plt

# 解析数据
def loadDataSet(file_name):
    \'\'\'
    Desc:
        加载并解析数据,应用范围是数据文件是.txt文件
    Args:
        file_name -- 文件名称,要解析的文件所在磁盘位置
    Returns:
        dataMat -- 原始数据的特征
        labelMat -- 原始数据的标签,也就是每条样本对应的类别
    \'\'\'
    # dataMat为原始数据, labelMat为原始数据的标签
    dataMat = []
    labelMat = []
    fr = open(file_name)
    for line in fr.readlines():
        lineArr = line.strip().split()
        if len(lineArr) == 1:
            continue    # 这里如果就一个空的元素,则跳过本次循环
        # 为了方便计算,我们将 X0 的值设为 1.0 ,也就是在每一行的开头添加一个 1.0 作为 X0
        dataMat.append([1.0, float(lineArr[0]), float(lineArr[1])])
        labelMat.append(int(lineArr[2]))
    return dataMat, labelMat


# sigmoid跳跃函数(有所改进)
def sigmoid(inX):
    # return 1.0 / (1 + exp(-inX))
    # Tanh是Sigmoid的变形,与 sigmoid 不同的是,tanh 是0均值的。因此,实际应用中,tanh 会比 sigmoid 更好。
    return 2 * 1.0/(1+exp(-2*inX)) - 1


# 随机梯度下降算法(随机化)
def stocGradAscent1(dataMatrix, classLabels, numIter=100):
    \'\'\'
    Desc:
        改进版的随机梯度下降,使用随机的一个样本来更新回归系数。步长a在这里是自适应的(可变的)
    Args:
        dataMatrix -- 输入数据的数据特征(除去最后一列数据)
        classLabels -- 输入数据的类别标签(最后一列数据)
        numIter=150 --  迭代次数
    Returns:
        weights -- 得到的最佳回归系数
    \'\'\'
    m, n = shape(dataMatrix)
    weights = ones(n)  # 创建与列数相同的矩阵的系数矩阵,所有的元素都是1,即回归系数的初始值
    # 随机梯度, 循环150,观察是否收敛
    for j in range(numIter):
        # [0, 1, 2 .. m-1]
        dataIndex = list(range(m))
        for i in range(m):
            # i和j的不断增大,导致alpha的值不断减少,但是不为0
            alpha = 4 / (
                1.0 + j + i
            ) + 0.0001  # alpha 会随着迭代不断减小,但永远不会减小到0,因为后边还有一个常数项0.0001
            # 随机产生一个 0~len()之间的一个值
            # random.uniform(x, y) 方法将随机生成下一个实数,它在[x,y]范围内,x是这个范围内的最小值,y是这个范围内的最大值。
            randIndex = int(random.uniform(0, len(dataIndex)))    #设置randIndex随机选取样本
            # sum(dataMatrix[i]*weights)为了求 f(x)的值, f(x)=a1*x1+b2*x2+..+nn*xn
            h = sigmoid(sum(dataMatrix[dataIndex[randIndex]] * weights))
            error = classLabels[dataIndex[randIndex]] - h
            # print weights, \'__h=%s\' % h, \'__\'*20, alpha, \'__\'*20, error, \'__\'*20, dataMatrix[randIndex]
            weights = weights + alpha * error * dataMatrix[dataIndex[randIndex]]
            del (dataIndex[randIndex])
    return weights


# 可视化展示
def plotBestFit(dataArr, labelMat, weights):
    \'\'\'
        Desc:
            将我们得到的数据可视化展示出来
        Args:
            dataArr:样本数据的特征
            labelMat:样本数据的类别标签,即目标变量
            weights:回归系数
        Returns:
            None
    \'\'\'

    n = shape(dataArr)[0]
    xcord1 = []
    ycord1 = []
    xcord2 = []
    ycord2 = []
    for i in range(n):
        if int(labelMat[i]) == 1:
            xcord1.append(dataArr[i, 1])
            ycord1.append(dataArr[i, 2])
        else:
            xcord2.append(dataArr[i, 1])
            ycord2.append(dataArr[i, 2])
    fig = plt.figure()
    ax = fig.add_subplot(111)
    ax.scatter(xcord1, ycord1, s=30, c=\'red\', marker=\'s\')
    ax.scatter(xcord2, ycord2, s=30, c=\'green\')
    x = arange(-3.0, 3.0, 0.1)
    """
    y的由来,卧槽,是不是没看懂?
    首先理论上是这个样子的。
    dataMat.append([1.0, float(lineArr[0]), float(lineArr[1])])
    w0*x0+w1*x1+w2*x2=f(x)
    x0最开始就设置为1叻, x2就是我们画图的y值,而f(x)被我们磨合误差给算到w0,w1,w2身上去了
    所以: w0+w1*x+w2*y=0 => y = (-w0-w1*x)/w2   
    """
    y = (-weights[0] - weights[1] * x) / weights[2]
    ax.plot(x, y)
    plt.xlabel(\'X\')
    plt.ylabel(\'Y\')
    plt.show()
    
# -----------------------------------------------------------------------------------------------------
# 测试主函数
def simpleTest():
    # 1.收集并准备数据
    path = "E:\ML_data\logistic.txt"
    dataMat, labelMat = loadDataSet(path)

    # print dataMat, \'---\n\', labelMat
    # 2.训练模型,  f(x)=a1*x1+b2*x2+..+nn*xn中 (a1,b2, .., nn).T的矩阵值
    # 因为数组没有是复制n份, array的乘法就是乘法
    dataArr = array(dataMat)
    # print dataArr
    # weights = gradAscent(dataArr, labelMat)
    # weights = stocGradAscent0(dataArr, labelMat)
    weights = stocGradAscent1(dataArr, labelMat)
    # print \'*\'*30, weights

    # 数据可视化
    plotBestFit(dataArr, labelMat, weights)


# --------------------------------------------------------------------------------
# 从疝气病症预测病马的死亡率
# 分类函数,根据回归系数和特征向量来计算 Sigmoid的值
def classifyVector(inX, weights):
    \'\'\'
    Desc:
        最终的分类函数,根据回归系数和特征向量来计算 Sigmoid 的值,大于0.5函数返回1,否则返回0
    Args:
        inX -- 特征向量,features
        weights -- 根据梯度下降/随机梯度下降 计算得到的回归系数
    Returns:
        如果 prob 计算大于 0.5 函数返回 1
        否则返回 0
    \'\'\'
    prob = sigmoid(sum(inX * weights))
    if prob > 0.5: return 1.0
    else: return 0.0


# 打开测试集和训练集,并对数据进行格式化处理
def colicTest():
    \'\'\'
    Desc:
        打开测试集和训练集,并对数据进行格式化处理
    Args:
        None
    Returns:
        errorRate -- 分类错误率
    \'\'\'
    path_train=\'E:\ML_data\MLiA_SourceCode\machinelearninginaction\Ch05\horseColicTraining.txt\'
    path_test=\'E:\ML_data\MLiA_SourceCode\machinelearninginaction\Ch05\horseColicTest.txt\'
    frTrain = open(path_train)
    frTest = open(path_test)
    trainingSet = []
    trainingLabels = []
    # 解析训练数据集中的数据特征和Labels
    # trainingSet 中存储训练数据集的特征,trainingLabels 存储训练数据集的样本对应的分类标签
    for line in frTrain.readlines():
        currLine = line.strip().split(\'\t\')
        lineArr = []
        for i in range(21):
            lineArr.append(float(currLine[i]))
        trainingSet.append(lineArr)
        trainingLabels.append(float(currLine[21]))
    # 使用 改进后的 随机梯度下降算法 求得在此数据集上的最佳回归系数 trainWeights
    trainWeights = stocGradAscent1(array(trainingSet), trainingLabels, 500)
    # trainWeights = stocGradAscent0(array(trainingSet), trainingLabels)
    errorCount = 0
    numTestVec = 0.0
    # 读取 测试数据集 进行测试,计算分类错误的样本条数和最终的错误率
    for line in frTest.readlines():
        numTestVec += 1.0
        currLine = line.strip().split(\'\t\')
        lineArr = []
        for i in range(21):
            lineArr.append(float(currLine[i]))
        if int(classifyVector(array(lineArr), trainWeights)) != int(
                currLine[21]):
            errorCount += 1
    errorRate = (float(errorCount) / numTestVec)
    print("the error rate of this test is: %f" % errorRate)
    return errorRate


# 调用 colicTest() 10次并求结果的平均值
def multiTest():
    numTests = 10
    errorSum = 0.0
    for k in range(numTests):
        errorSum += colicTest()
    print("after %d iterations the average error rate is: %f" % (numTests, errorSum / float(numTests)))


if __name__ == \'__main__\':
    # simpleTest()
    multiTest()

View Code

其结果大概是错误率32%左右

 

上面是书中的自写模块,更详细的可以参考这里。下面是sklearn中的模块进行逻辑回归预测,还是针对病马数据集,注意这里的病马数据集是已经处理过的:

这里隐去了数据标准化,因为自己写的模块中也没有数据标准化,方便对比,其实数据标准化后的结果反而还差一点。至于建模函数LogisticRegressionCV的选择(有三个逻辑回归建模函数)以及里面的参数解释可以看这里

 

 

 

 

 

 

  

 

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