2020 第九届全国生物信息学与系统生物学学术大会

http://ccbsb2020.dtces.com/zyj.pdf

第九届全国生物信息学与系统生物学学术大会

The 9th National Conference on Bioinformatics and Systems Biology of China

2020年9月26日-29日 上海·圣诺亚皇冠假日酒店

会议日程

  27日 28日 29日
时间 亚美1厅 亚美2厅 亚美3厅 亚美1厅 亚美2厅 亚美3厅 亚美1厅 亚美2厅 亚美3厅
08:30-09:00
开幕式、颁奖仪式		 S4:生物网络与计算系统生物学(1) S5:生物大分子结构模拟、预测与药物分子设计(1) S6:表观遗传与转录调控组学(1) S10:生物信息学与植物科学、农业科学 S11:人工智能与生物信息学 S12:非编码RNA的识别与应用
09:00-09:30
09:30-10:00 茶歇
10:00-10:30

特邀报告、大会报告

 茶歇
10:30-11:00 S4:生物网络与计算系统生物学(2) S5:生物大分子结构模拟、预测与药物分子设计(2) S6:表观遗传与转录调控组学(2)
11:00-11:30 茶歇
11:30-12:00
自助午餐
大会报告、闭幕式
12:00-12:30 自助午餐
12:30-13:00   自助午餐
13:00-13:30   企业专场
（华大智造）		 企业专场
（浪潮商用）		   企业专场
（华为）		    
13:30-14:00

S1:计算、进化与比较基因组学

S2:单细胞组学分析方法与应用

S3:新冠病毒研究与转化医学信息学

S7:生物大数据的审编与整合

S8:微生物组学分析方法与应用

S9:复杂疾病的系统生物学

  
14:00-14:30
14:30-15:00
15:00-15:30
15:30-16:00
16:00-16:30 茶歇
16:30-17:00 生物信息教学座谈 T1:计算蛋白质组学 青年科研生涯座谈 T2:计算合成生物学 T3:表型组学 T4:脑科学与生物信息学
17:00-17:30
17:30-18:30 自助晚餐  
18:30-19:00   功能基因组信息学与系统生物学分会理事会  

晚宴
19:00-19:30
19:30-20:00
dataendend
 

 

详细日程

9月26日

14:00-20:00

报到注册

报到地点：上海圣诺亚皇冠假日酒店一楼大厅
   

9月27日 上午

亚美厅
08:30-09:00

大会开幕式

（主持人：王秀杰 研究员）
09:00-09:30

颁奖仪式 

（主持人：肖奕 教授）
09:30-10:00 茶歇
10:00-10:45

特邀报告

（主持人：孙之荣 教授）
10:00-10:45 陈润生 院士  中国科学院生物物理研究所
报告题目： 从新冠病毒、精准医学到核酸药物
10:45-12:00

大会报告

（主持人：来鲁华 教授）
10:45-11:20 李亦学 研究员  中国科学院上海营养与健康研究所 
报告题目： 多层次信息整合的分子溯源揭示 SARS-CoV2 传播过程 
11:20-11:55 陈洛南 研究员  中国科学院生物化学与细胞生物学研究所 
报告题目： 网络标志物的疾病诊断和动态网络标志物的疾病预警 
   

9月27日 下午

亚美 1 厅
13:30-16:00

主题 S1: 计算、进化与比较基因组学

（主持人：季星来 教授、叶凯 教授）
13:30-13:50 陈卫华 教授 华中科技大学 
报告题目： Linking Gut Dysbiosis to Human Health: Resources, Tools and Cofounding Factors
13:50-14:10 寸玉鹏 研究员 中国科学院昆明植物研究所 
报告题目： 癌症基因组中的克隆和子克隆演化结构推断 
14:10-14:30 焦远年 研究员 中国科学院植物研究所 
报告题目： 基因组加倍与植物适应性进化 
14:30-14:50 李飞 教授 浙江大学 
报告题目： 昆虫基因组：仍需挖掘的财富 
14:50-15:10 钟伯坚 教授 南京师范大学
报告题目： 南极衣藻适应极端环境的进化基因组学研究 
15:10-15:25 陈振夏 教授 华中农业大学 
报告题目： Anti-masculinization Induced by Aromatase Inhibitors in Adult Female Zebrafish 
15:25-15:40 叶凯 教授 西安交通大学 
报告题目： Mako: a Graph-based Pattern Growth Approach to Detect Complex Structural Variants 
15:40-15:55 杜政霖 高级工程师 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： Whole Genome Analyses of a Healthy Chinese Population 
16:00-16:30 茶歇 
16:30-17:30

生物信息教学座谈

（主持人：高歌 研究员、张勇 教授）
 

亚美 2 厅
13:00-13:30

企业专场：深圳华大智造科技股份有限公司

（主持人：陈洛南 研究员）
13:00-13:10 唐岳 博士 深圳华大智造科技股份有限公司 
报告题目： DNBSEQ 测序技术原理及多平台数据对比 
13:10-13:30 徐书华 研究员 中国科学院 – 马普学会计算生物学伙伴研究所  
报告题目： 汉族人群的精细遗传结构解析 
13:30-16:00

主题 S2: 单细胞组学分析方法与应用

（主持人：陈铭 教授、高歌 研究员）
13:30-13:50 张世华 研究员 中国科学院数学与系统科学研究院 
报告题目： Computational Methods for Scalable Embedding and Network Reconstruction using Single-cell ATAC-seq Data 
13:50-14:10 郭国骥 教授 浙江大学 
报告题目： Mapping Mammalian Cell Landscapes by Single-cell mRNA-seq 
14:10-14:30 苏建忠 教授 温州医科大学 
报告题目： 单细胞转录谱功能通路活性挖掘在寻找癌细胞起源的应用研究 
14:30-14:50 任仙文 副研究员 北京大学 
报告题目： 基于单细胞转录组测序数据从头重构细胞空间关系 
14:50-15:10 曾婉雯 博士 南开大学 
报告题目： 整合单细胞及群体细胞多组学数据的统一数学框架 
15:10-15:25 邓明华 教授 北京大学 
报告题目： Deep Soft K-means Clustering with Self-training for Single-cell RNA Sequence Data 
15:25-15:40 王晨飞 研究员 同济大学 
报告题目： Integrative Analyses of Single-cell Transcriptome and Regulome using MAESTRO 
15:40-15:55 胡宇轩 讲师 西安电子科技大学 
报告题目： CytoTalk: De novo Construction of Signal Transduction Networks using Single-cell RNA-Seq Data 
16:00-16:30 茶歇 
16:30-17:30

特色专题 T1: 计算蛋白质组学

（主持人：邓海腾 教授、薛宇 教授）
16:30-16:50 王通 教授 暨南大学 
报告题目： 蛋白质组数据的深度挖掘人类新蛋白质组的发现
16:50-17:10 邓海腾 教授 清华大学 
报告题目： Multi-omics Analysis Defines Biomarkers for Renal Aging
17:10-17:25 李健 教授 东南大学 
报告题目：Using Structural Analysis to Explore the Role of HBV Mutations in Immune Escape from Liver Cancer in Chinese, European and American Populations
 

亚美 3 厅
13:00-13:30

企业专场：浪潮商用机器有限公司
13:00-13:15 王泽峰 研究员 中国科学院 – 马普学会计算生物学伙伴研究所 
报告题目： 利用异构计算实现海量转录组的快速定量分析
13:15-13:30 房树新 总经理 浪潮商用机器有限公司技术支持部 
报告题目： HPDA 硬件平台选择和实践分享
13:30-16:00

主题 S3: 新冠病毒研究与转化医学信息学

（主持人：沈百荣 教授、弓孟春 研究员）
13:30-13:50 刘莉 教授 南方医科大学 
报告题目： 基于电子病历数据的疾病严重程度分型预警 : HNC-LL Model for COVID-19
13:50-14:10 宁尚伟 教授 哈尔滨医科大学 
报告题目： 基于组学大数据的新冠病毒基因功能预测与潜在药物筛选
14:10-14:30 宋述慧 副研究员 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： 新型冠状病毒信息资源整合及变异分析
14:30-14:50 弓孟春 研究员 南方医科大学 
报告题目： Data-driven Hybrid Surveillance System for COVID-19: the Honghu System
14:50-15:10 瞿昆 教授 中国科学技术大学 
报告题目： Single Cell Analysis of Severe COVID-19 Patients Reveals a Monocyte-associated and Tocilizumab-responding Cytokine Storm
15:10-15:25 吴爱平 研究员 中国医学科学院苏州系统医学研究所 
报告题目： Compositional Diversity and Evolutionary Pattern of Genomes ofSARS-CoV-2 and Related Coronaviruses
15:25-15:40 张泽宇 同济大学 
报告题目： Virus Knowledge Mining from Literatures to Identify the Key Factors in the Virus and Host Cell Interaction
15:40-15:55 李俊 教授 天津医科大学 
报告题目： The Support of Genetic Evidence for Cardiovascular Risk Induced by Antineoplastic Drugs
16:00-16:30 茶歇
16:30-17:30

青年科研生涯座谈

（主持人：赵兴明 教授、汪小我 副教授）

9月27日 晚间

亚美 2 厅
18:30-20:00

功能基因组信息学与系统生物学分会理事会

（主持人：孙之荣 教授、李霞 教授）
（仅限功能基因组信息学与系统生物学分会理事参加）

9月28日 上午

亚美 1 厅
08:30-11:30

主题 S4: 生物网络与计算系统生物学

（主持人：周天寿 教授、高琳 教授）
08:30-08:50 曾坚阳 副教授 清华大学 
报告题目： 机器智能赋能新药研发 
08:50-09:10 黄胜友 教授 华中科技大学 
报告题目： Protein-protein Contact Prediction for Integrative Protein Docking
09:10-09:30 李松挺 副教授 上海交通大学 
报告题目： 大脑网络结构中的最大熵原理 
09:30-09:50 王勇 研究员 中国科学院数学与系统科学研究院 
报告题目： 解释遗传变异的调控网络建模 
09:50-10:10 张家军 副教授 中山大学 
报告题目： Modelling and Analysis of Non-Markovian Biochemical Reaction Networks 
10:10-10:40 茶歇 
10:40-10:55 张乃千 副教授 山东大学 
报告题目： DiverRWH: Discovering Personalized Cancer Driver Genes by Hypergraph Model 
10:55-11:10 赵程辰 博士 同济大学 
报告题目： A DNA Methylation State Transition Model Reveals the Programmed Epigenetic Heterogeneity in Human Pre-implantation Embryos 
11:10-11:25 刘雪明 博士 华中科技大学 
报告题目： Robustness and Lethality in Multilayer Biological Molecular Networks 
 

亚美 2 厅
08:30-11:30

主题 S5: 生物大分子结构模拟、预测与药物分子设计

（主持人：来鲁华 教授、王炜 教授）
08:30-08:50 卜东波 研究员 中国科学院计算技术研究所 
报告题目： FALCON-ProFOLD: 基于人工智能技术的蛋白质结构“从头预测”算法 
08:50-09:10 龚海鹏 副教授 清华大学 
报告题目： Predicting the Real-valued Inter-residue Distances for Proteins 
09:10-09:30 王文宁 教授 复旦大学 
报告题目： 固有无序蛋白的模糊相互作用：在分子模拟的显微镜下 
09:30-09:50 宋晨 研究员 北京大学 
报告题目： Push to Open: The Gating Mechanism of the Tethered Mechanosensitive Ion Channel NompC 
09:50-10:10 董昊 教授 南京大学 
报告题目： Development and Application of Enhanced Sampling Method of Biomolecular Conformations Based on Feature Space of Structures
10:10-10:40 茶歇 
10:40-10:55 杨建益 教授 南开大学 
报告题目： Accurate and Fast De Novo Protein Structure Prediction through Deep Learning and Rosetta 
10:55-11:10 曹志伟 教授 同济大学 
报告题目： H-RACS: a Handy Tool to Rank Anti-cancer Synergistic Drugs 
11:10-11:25 陈海峰 教授 上海交通大学 
报告题目： Intrinsically Disordered Protein Specific Force Field CHARMM36IDPSFF
 

亚美 3 厅
08:30-11:30

主题 S6: 表观遗传与转录调控组学

（主持人：王泽峰 研究员、李国亮 教授）
08:30-08:50 李程 研究员 北京大学 
报告题目： 三维基因组与疾病 
08:50-09:10 伊成器 研究员 北京大学 
报告题目： Mapping the Functional and Regulatory Landscape of m6Am in the Mammalian Transcriptome 
09:10-09:30 吴强 教授 上海交通大学 
报告题目： 三维基因组 CTCF 拓扑绝缘子作用机制研究 
09:30-09:50 韩敬东 教授 北京大学 
报告题目： 人类衰老速率的异质性 
09:50-10:10 李昕 研究员 中国科学院上海营养与健康研究所 
报告题目： 非编码区遗传变异功能解析的多组学方法 
10:10-10:40 茶歇 
10:40-10:55 孙啸 教授 东南大学 
报告题目： G-quadruplexes May Regulate Gene Transcription by Affecting the Three-dimensional Chromatin Structure 
10:55-11:10 江赐忠 教授 同济大学 
报告题目： Dux-mediated Corrections of Aberrant H3K9ac during 2-cell Genome Activation Optimizes Efficiency of Somatic Cell Nuclear Transfer 
11:10-11:25 蔡禄 教授 内蒙古科技大学 
报告题目： Transcriptome Analysis Reveals a Silica-induced Immune Response, Fibrosis Character and Alternative Splicing Profile in a Silicosis Rat Model

9月28日 下午

亚美 1 厅
13:30-16:00

主题 S7: 生物大数据的审编与整合

（主持人：章张 研究员、刘雷 教授）
13:30-13:50 钟凡 副研究员 复旦大学 
报告题目： 精准医学知识图谱构建 
13:50-14:10 李姣 研究员 中国医学科学院医学信息研究所 
报告题目： 精准医学本体和语义网络构建与应用 
14:10-14:30 徐娟 教授 哈尔滨医科大学 
报告题目： 整合生物大数据解析长链非编码调控与功能 
14:30-14:50 张岩 教授 哈尔滨工业大学 
报告题目： 基于组学数据和临床信息的整合分析及其肿瘤标志物挖掘 
14:50-15:10 章张 研究员 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： 国家生物信息中心数据资源 
15:10-15:25 黄丹丹 天津医科大学 
报告题目： Ultrafast and Scalable Variant Annotation and Prioritization with Big Functional Genomics Data
15:25-15:40 邹东 工程师 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： BIG Search: a Cross-database Search System for Multi-dimensional Biological Big Data 
15:40-15:55 朱山风 副教授 复旦大学 
报告题目： Recent Advances in Large-scale Biomedical Semantic Indexing 
16:00-16:30 茶歇 
16:30-17:30

特色专题 T2: 计算合成生物学

（主持人：戴俊彪 研究员、郭锋彪 教授）
16:30-16:50 戴俊彪 研究员 中国科学院深圳先进技术研究院 
报告题目： A Completely Designer Chromosome Arm Functions in Yeast
16:50-17:10 汪小我 副教授 清华大学 
报告题目： 基因调控元件的人工智能设计
17:10-17:30 娄春波 研究员 中国科学院深圳先进技术研究院 
报告题目： 可预测组装调控元件的设计原则
 

亚美 2 厅
13:00-13:30

企业专场：华为技术有限公司
13:00-13:30 徐迟 博士 华为云与计算业务部 
报告题目： 自动 AI 建模在基因组领域中的应用和实践 
13:30-16:00

主题 S8: 微生物组学分析方法与应用

（主持人：宁康 教授、高峰 教授）
13:30-13:50 赵方庆 研究员 中国科学院北京生命科学研究院 
报告题目： 人体微生物与新生儿健康 
13:50-14:10 高峰 教授 天津大学 
报告题目： Comprehensive Analysis and Genome-wide Prediction of DNA Replication Origins in Saccharomyces Cerevisiae
14:10-14:30 崔杰 研究员 中国科学院上海巴斯德研究所 
报告题目： 病毒进化与病毒圈 
14:30-14:50 李明锟 研究员 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： 呼吸道微生物组研究进展与方法
14:50-15:10 朱怀球 教授 北京大学 
报告题目： Computational Method Study for Phages and Plasmids from Metagenomic Sequences
15:10-15:25 欧竑宇 教授 上海交通大学 
报告题目： Identification and Characterization of Bacterial Toxin-antitoxin Loci 
15:25-15:40 左光宏 副教授 复旦大学 
报告题目： CVTree: Whole-Genome-Based and Alignment-Free Phylogeny/ Taxonomy of Prokaryotes 
15:40-15:55 陈非 研究员 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： Altered Gut Microbiota in Parkinson’s Disease Patients/Healthy Spouses and its Association with Clinical Features 
16:00-16:30 茶歇 
16:30-17:30

特色专题 T3: 表型组学

（主持人：田卫东 教授、汪思佳 研究员）
16:30-16:50 田卫东 教授 复旦大学 
报告题目： 整合临床表型和基因组变异信息筛选罕见遗传病
16:50-17:10 曾涛 副研究员 中国科学院上海生物化学与细胞生物学研究所 
报告题目： 基于网络数量性状位点的基因型 – 表型关联模型 
17:10-17:25 李嘉睿 中国科学院上海营养与健康研究所 
报告题目： Hierarchical Segmentation based 3D Facial Genetics Analysis 
 

亚美 3 厅
13:30-16:00

主题 S9: 复杂疾病的系统生物学

（主持人：李霞 教授、崔庆华 教授）
13:30-13:50 王秀杰 研究员 中国科学院遗传与发育生物学研究所 
报告题目： 重复序列扩增疾病与抗新冠病毒药物预测 
13:50-14:10 沈百荣 教授 四川大学 
报告题目： 复杂疾病生物标志物寻找的原理与应用 
14:10-14:30 樊龙江 教授 浙江大学 
报告题目： ePmiRNA_finder: Identification of Extracellular Plant miRNAs in Human and Animals 
14:30-14:50 郭安源 教授 华中科技大学  
报告题目：Bioinformatics Methods and Applications for T-cell Immunology and Immune Checkpoint Therapy 
14:50-15:10 李永生 教授 哈尔滨医科大学 
报告题目： Systematically Analyzing the Regulation of Immune Pathways Identifies Potential Oncogenic Biomarkers
15:10-15:25   罗怀超 博士 四川省肿瘤医院 
报告题目： Reference Gene Selection for Quantitative Gene Expression Analysis in Platelet of Tumor 
15:25-15:40 王海芸 副教授 同济大学 
报告题目： An Integrative Pharmacogenomics Analysis Identifies CK2 Alpha as a Promising Therapeutic Target in KRAS(G12C) Mutant Lung Cancer 
15:40-15:55 王鹏 副教授 哈尔滨医科大学 
报告题目： 复杂疾病相关lncRNA竞争三元组机制解析与精准医疗 
16:00-16:30 茶歇 
16:30-17:30

特色专题 T4: 脑科学与生物信息学

（主持人：赵兴明 教授、王建新 教授）
16:30-16:50 赵兴明 教授 复旦大学 
报告题目： 大数据时代的脑科学：张江国际脑库介绍 
16:50-17:10 诸颖 研究员 复旦大学 
报告题目： Human Brain Evolution: Insights from Transcriptome Analysis 
17:10-17:30 纪志梁 教授 厦门大学 
报告题目： Germline OGDHL Variant Could be a Major Driving Genetic Factor to Cause Chinese Familial Major Depression Disorder 

9月29日 上午

亚美 1 厅
08:30-11:00

主题 S10: 生物信息学与植物科学、农业科学

（主持人：钟伯雄 教授、张红雨 教授）
08:30-08:50 宋晓峰 教授 南京航空航天大学 
报告题目： 环形 RNA 编码蛋白潜能的生物信息学研究 
08:50-09:10 谢为博 教授 华中农业大学 
报告题目： 水稻基因组序列变异的功能注释 
09:10-09:30 马 闯 教授 西北农林科技大学 
报告题目： 植物转录组数据大规模整合与挖掘 
09:30-09:50 张一婧 研究员 中国科学院上海植物生理生态研究所 
报告题目： 遗传与表观遗传互作决定普通小麦亚基因组分化的分子机制研究 
09:50-10:10 陈迪俊 研究员 南京大学 
报告题目： ChIP-Hub: an Integrative Platform for Exploring Plant Regulome 
10:10-10:25 徐扬 博士 扬州大学 
报告题目： Incorporation of Parental Phenotypic Data into Multi-omic Models Improves Prediction of Yield-related Traits in Hybrid Rice 
10:25-10:40 邢永强 副教授 内蒙古科技大学 
报告题目： The Detection of Differentially Expressed Gene and Atlas Construction of Pre-mRNA Alternative Splicing during Seed Germination of Arabidopsis Thaliana
10:40-10:55 谢婷 副研究员 中国农业科学院油料作物研究所 
报告题目： Biased Gene Retention during Diploidization in Brassica Linked to Three-dimensional Genome Organization
11:00-11:20 茶歇 
 

亚美 2 厅
08:30-11:00

主题 S11: 人工智能与生物信息学

（主持人：肖奕 教授、黄德双 教授）
08:30-08:50 黄德双 教授 同济大学 
报告题目： Deep Learning for Motif Mining in DNA/RNA Sequences 
08:50-09:10 张建 教授 南京大学 
报告题目： Computational Prediction of RNA Tertiary Structures using Machine Learning Methods 
09:10-09:30 薛宇 教授 华中科技大学 
报告题目： Artificial Intelligence Biology: from PTM to COVID-19 
09:30-09:50 邹权 教授 电子科技大学 
报告题目： 新的集成分类、降维策略与生物信息应用 
09:50-10:10 骆嘉伟 教授 湖南大学 
报告题目： 基于深度学习的微生物相关预测研究 
10:10-10:25 龚新奇 教授 中国人民大学 
报告题目： Functional Multimer Protein-protein Interaction Complex Structure Prediction by Machine Learning Approaches
10:25-10:40 曹智杰 博士 北京大学 
报告题目： Querying Heterogeneous Single-cell Transcriptomics Datasets via Adversarial Learning 
10:40-10:55 王银鹰 博士 同济大学 
报告题目： INSCT: Integrating Millions of Single Cells using Batch-aware Triplet Neural Networks 
11:00-11:20 茶歇 
 

亚美 3 厅
08:30-11:00

主题 S12: 非编码 RNA 的识别与应用

（主持人：王秀杰 研究员、赵方庆 研究员）
08:30-08:50 薛愿超 研究员 中国科学院生物物理研究所 
报告题目： Higher-order Structure and Function of Noncoding RNA 
08:50-09:10 崔庆华 教授 北京大学 
报告题目： MicroRNA 集合分析：概念、方法与应用 
09:10-09:30 李川昀 研究员 北京大学 
报告题目： Understanding Human Evolution in the Genomic Framework of Rhesus Monkey
09:30-09:50 张强锋 研究员 清华大学 
报告题目： RNA Systems Biology Powered by Big Data and Machine Intelligence 
09:50-10:10 杨雪瑞 研究员 清华大学 
报告题目： 细胞核仁中 lncRNA 的关键角色：从数据挖掘到分子机制
10:10-10:25 马利娜 副研究员 中国科学院北京基因组研究所 
报告题目： Multi-omics Annotation of Human Long Non-coding RNAs 
10:25-10:40 刘元宁 教授 吉林大学 
报告题目： ncRFP: a Novel End-to-end Method for Non-coding RNA Family Prediction Based on Deep Learning
10:40-10:55 闫玲娟 内蒙古大学 
报告题目： Prediction of Plant Long Non-coding RNA and its Function Analysis 
11:00-11:20 茶歇 
 

亚美厅
11:20-12:30

大会报告

（主持人：李霞 教授）
11:20-11:55 杨力 研究员 中国科学院 – 马普学会计算生物学伙伴研究所 
报告题目： Splicing circRNAs from the Inside Out 
11:55-12:30 张泽民 教授 北京大学 
报告题目： 单细胞生物信息学及其在肿瘤免疫微环境的应用 
12:30-12:40

 大会闭幕式

（主持人：李霞 教授）

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