%主程序代码,本程序采用遗传算法接力进化，
%将上次进化结束后得到的最终种群作为下次输入的初始种群
%主程序代码,
clc;
close all;
clear all;

% 进化的代数
T=50;
% 初始的种群
options=gaoptimset(\'Generations\',T);
[x,fval,reason,output,final_pop]=ga(@fitnessfun,1,options);

%进行第二次接力进化
options1=gaoptimset(\'Generations\',T,\'InitialPopulation\',final_pop,\'PlotFcns\',@gaplotbestf);
[x,fval,reason,output,final_pop]=ga(@fitnessfun,1,options1);

Bestx=x
BestFval=-fval


% 适应度函数
function f = fitnessfun(x)
    if(x<-2|x>2)
        f=100;
    else
        f=-200*exp(-0.05*x)*sin(x);
    end
end

%主程序代码,本程序采用遗传算法接力进化，
%将上次进化结束后得到的最终种群作为下次输入的初始种群
clc;
close all;
clear all;

%进化的代数
T=100;
optionsOrigin=gaoptimset(\'Generations\',T);
[x,fval,reason,output,finnal_pop]=ga(@fitnessfun,2,optionsOrigin);

%进行第二次接力进化
options1=gaoptimset(\'Generations\',T,\'InitialPopulation\',finnal_pop,\'PlotFcns\',@gaplotbestf);
[x,fval,reason,output,finnal_pop,trace]=ga(@fitnessfun,2,options1);

Bestx=x
BestFval=fval


% 适应度函数
function f = fun(x)
    g1=1.5+x(1)*x(2)-x(1)-x(2);
    g2=-x(1)*x(2)-10;
    if (g1>0|g2>0)
        f=100;
    else
        f=exp(x(1))*(4*x(1)^2+2*x(2)^2+4*x(1)*x(2)+2*x(2)+1);;    
    end
end

%主程序：
%用遗传算法求解y=200*exp(-0.05*x).*sin(x)在[-2 2]区间上的最大值
clc;
clear all;
close all;

global BitLength
global boundsbegin
global boundsend
bounds=[-2 2];%一维自变量的取值范围
precision=0.0001; %运算精度
boundsbegin=bounds(:,1);
boundsend=bounds(:,2);
%计算如果满足求解精度至少需要多长的染色体
BitLength=ceil(log2((boundsend-boundsbegin)\' ./ precision));
popsize=50; %初始种群大小

Generationnmax=100;  %最大代数
pcrossover=0.90; %交配概率
pmutation=0.09; %变异概率
%产生初始种群
population=round(rand(popsize,BitLength));
%计算适应度,返回适应度Fitvalue和累积概率cumsump
[Fitvalue,cumsump]=fitnessfun(population);  
Generation=1;
while Generation<Generationnmax+1
   for j=1:2:popsize 
      %选择操作
      seln=selection(population,cumsump);
      %交叉操作
      scro=crossover(population,seln,pcrossover);
      scnew(j,:)=scro(1,:);
      scnew(j+1,:)=scro(2,:);
      %变异操作
      smnew(j,:)=mutation(scnew(j,:),pmutation);
      smnew(j+1,:)=mutation(scnew(j+1,:),pmutation);
   end
   population=smnew;  %产生了新的种群
   %计算新种群的适应度   
   [Fitvalue,cumsump]=fitnessfun(population);
   %记录当前代最好的适应度和平均适应度
   [fmax,nmax]=max(Fitvalue);
   fmean=mean(Fitvalue);
   ymax(Generation)=fmax;
   ymean(Generation)=fmean;
   %记录当前代的最佳染色体个体
   x=transform2to10(population(nmax,:));
   %自变量取值范围是[-2 2],需要把经过遗传运算的最佳染色体整合到[-2 2]区间
  xx=boundsbegin+x*(boundsend-boundsbegin)/(power((boundsend),BitLength)-1);
   xmax(Generation)=xx;
   Generation=Generation+1
end
Generation=Generation-1;
Bestpopulation=xx
Besttargetfunvalue=targetfun(xx)
%绘制经过遗传运算后的适应度曲线。一般地，如果进化过程中种群的平均适应度与最大适
%应度在曲线上有相互趋同的形态，表示算法收敛进行得很顺利，没有出现震荡；在这种前
%提下，最大适应度个体连续若干代都没有发生进化表明种群已经成熟。
figure(1);
hand1=plot(1:Generation,ymax);
set(hand1,\'linestyle\',\'-\',\'linewidth\',1.8,\'marker\',\'*\',\'markersize\',6)
hold on;

hand2=plot(1:Generation,ymean);
set(hand2,\'color\',\'r\',\'linestyle\',\'-\',\'linewidth\',1.8,...
\'marker\',\'h\',\'markersize\',6)
xlabel(\'进化代数\');ylabel(\'最大/平均适应度\');xlim([1 Generationnmax]);
legend(\'最大适应度\',\'平均适应度\');
box off;hold off;


%子程序：新种群交叉操作,函数名称存储为crossover.m
function scro=crossover(population,seln,pc);
BitLength=size(population,2);
pcc=IfCroIfMut(pc);  %根据交叉概率决定是否进行交叉操作，1则是，0则否
if pcc==1
   chb=round(rand*(BitLength-2))+1;  %在[1,BitLength-1]范围内随机产生一个交叉位
   scro(1,:)=[population(seln(1),1:chb) population(seln(2),chb+1:BitLength)];
   scro(2,:)=[population(seln(2),1:chb) population(seln(1),chb+1:BitLength)];
else
   scro(1,:)=population(seln(1),:);
   scro(2,:)=population(seln(2),:);
end  


%子程序：计算适应度函数, 函数名称存储为fitnessfun
function [Fitvalue,cumsump]=fitnessfun(population);
global BitLength
global boundsbegin
global boundsend
popsize=size(population,1);   %有popsize个个体
for i=1:popsize
   x=transform2to10(population(i,:));  %将二进制转换为十进制
    %转化为[-2,2]区间的实数
xx=boundsbegin+x*(boundsend-boundsbegin)/(power((boundsend),BitLength)-1); 
   Fitvalue(i)=targetfun(xx);  %计算函数值，即适应度
end
%给适应度函数加上一个大小合理的数以便保证种群适应值为正数
Fitvalue=Fitvalue\'+230;
%计算选择概率
fsum=sum(Fitvalue);
Pperpopulation=Fitvalue/fsum;
%计算累积概率
cumsump(1)=Pperpopulation(1);
for i=2:popsize
   cumsump(i)=cumsump(i-1)+Pperpopulation(i);
end
cumsump=cumsump\';

%子程序：新种群变异操作，函数名称存储为mutation.m
function snnew=mutation(snew,pmutation);
BitLength=size(snew,2);
snnew=snew;
pmm=IfCroIfMut(pmutation);  %根据变异概率决定是否进行变异操作，1则是，0则否
if pmm==1
   chb=round(rand*(BitLength-1))+1;  %在[1,BitLength]范围内随机产生一个变异位
   snnew(chb)=abs(snew(chb)-1);
end   


%子程序：判断遗传运算是否需要进行交叉或变异, 函数名称存储为IfCroIfMut.m
function pcc=IfCroIfMut(mutORcro);
test(1:100)=0;
l=round(100*mutORcro);
test(1:l)=1;
n=round(rand*99)+1;
pcc=test(n);  


%子程序：新种群选择操作, 函数名称存储为selection.m
function seln=selection(population,cumsump);
%从种群中选择两个个体
for i=1:2
   r=rand;  %产生一个随机数
   prand=cumsump-r;
   j=1;
   while prand(j)<0
       j=j+1;
   end
   seln(i)=j; %选中个体的序号
end


%子程序：将2进制数转换为10进制数,函数名称存储为transform2to10.m
function x=transform2to10(Population);
BitLength=size(Population,2);
x=Population(BitLength);
for i=1:BitLength-1
   x=x+Population(BitLength-i)*power(2,i);
end


%子程序：对于优化最大值或极大值函数问题，目标函数可以作为适应度函数
%函数名称存储为targetfun.m
function y=targetfun(x); %目标函数
y=200*exp(-0.05*x).*sin(x);